윌리엄 릴리가  특별히 지신있어 했던 것은 질문이 막 다루어졌을 때 특정 사건이나 일의  길흉을 점치는 호라리 점성술(Horary Astrology)이었다. (호라리 점성술은 동양에서 단시점(短蓍店)을 다루는 육임과 같은 맥락으로 이해하면 될 것이다.) 또한 탄생시 점성술(Nativitiy astrology 한 개인의 출생 연, 월, 일, 시, 분에 의해 시기를 판단하는 점성술 (동양에서는  사주 명리학과 같은  것이다.)과 국가의 운을 점치는 먼데인 점성술(Mundane Astrology)에서도 비범한 재능을 보였다.

윌리엄 릴리는 점성술사로서의 직업윤리를 중요시 하였으며, 초반에는 주로 중류 계급의 부인들을  상대로 점성술 상담을 하였다.  그 상담이 잘 맞고  신뢰를 얻게 되자 국회의원이나  귀족들이 고객이  되었다. 1644년 윌리엄 릴리는 『점성력(Almanac)』을 출간했다. 이 것이 유명한 『메르리누스 앙리크스』의 달력이다. 이 달력은 염가로 판매했기 때문에 1년간의 발행부수가 1만부 이상이 팔리는 경이적인 베스트셀러가 되었다.

윌리엄 릴리는 정치에도 관심을 가지고 있었다. 윌리엄 릴리는 당시 의회파와 왕당파의  대립을  점쳐 의회파가 유리하다고 판단을 내렸다. 이윽고 퓨리턴 혁명이 일어났고 윌리엄 릴리는 혁명파의 승리를 에언했다.  의회파는 당시의 유명한  점성가였던 윌리엄 릴리를 선전에 많이 이용했고  릴리의 예언은 적중했다. 내란은 의회파의 승리로 끝나 왕제는 폐위된다. 하지만 정권을 장악한 혁명군의 지도자  올리버 크롬웰은 냉혹한 독재자의 길을  걸어간다. 이로써 윌리엄 릴리는 패배한 왕당파를 감싸게 되고  점성술을 통해 찰스 1세가  혁명파에 의해 처형될 것을 예측하고 찰스 1세를 위해 망명하는 방법을 점쳐서  은밀하게 전한다. 그러나 찰스 1세는 이를 무시라고 군을 일으켰다가 혁명파에 붙잡혀 처형을 당한다. 또한 릴리는 왕당파가 세력을 만회해 왕정복고가 일어난다는 것을 예언하였다. 그리고 이 예측은 적중했다.